Oui tu te trompes ! 
Ubuntu et Debian sont basé sur le même principe (celui de debian d’ou les .deb) en utilisant les même processeurs, et les même programmes (puisque qu’ils sont maintenus, avec en gros les mêmes directives de compilation) les deux systèmes sont à peut près compatible. Mais debian et Ubuntu n’utilise pas les mêmes dépots, et l’agencement des méta paquets peut varier, suivant les goûts et les couleurs des mainteneurs des deux distributions (même si j’ai quand même l’impression, qu’ils ne s’éloignent pas trop les uns des autres exprès).
Donc un paquet “.deb” qu’un développeur a réalisé dans son coin, a de forte chance d’être instalable directement avec l’une ou l’autre des distributions (possible différence de dépendance, mais rien de bien méchant)
Les notions de Universe, Multiverse sont en les dépôts Contrib et non-free de debian.
Mais à toi maintenant, quelles différences, ou quels paquets te manques ?